Vig. Epidemiologica

Row

Suspeitos

431111 ( + 1857 )

Confirmados

49955 ( + 263 )

Internados

410 ( - 10 )

Row

Intensivos

50 ( - 2 )

Recuperados

35010 ( + 323 )

Óbitos

1716 ( + 4 )

Row

Confirmados

Novos casos

Mapa confirmados

Recuperados

Suspeitos

Previsão da evolução

Row

Previsao número de novos casos (próximas 24 horas)

511

Tempo de duplicação de casos (dias)

64 ( 44.7 - 112.6 )

Número médio de casos secundários por nova infecção, Rt

0.8 ( 0.8 - 0.9 )

Row

Previsão do número de novos casos de COVID-19 a 3 dias

Número reprodutivo diário \(R_{t}\)

Métodos

Previsão

Foi utilizado um modelo linear-logarítmico referente aos dados de novos casos reportados:

\[ log (y) = r * t + b \] onde:

  • y é o número de novos casos

  • t é o tempo desde o início de observação do surto (em dias)

  • r é a taxa de crescimento por período de tempo t

  • b é o número de casos (escala logarítmica) no início do surto

É realizada diariamente uma actualização da previsão com todos os dados reportados disponíveis. A previsão efectuada do número de novos casos abrange a janela temporal de 3 dias desde o último dia de reporte e actualização dos dados.

Os valores de previsão devem ser interpretados face ao número reduzido de dias de observação bem como à aplicação de medidas de âmbito populacional que contrariem os pressupostos do modelo utilizado.

Os valores apresentados como “Novos casos (modelo)” representam o número de casos estimados pelo modelo para uma determinada data observada. A diferenca entre este número e o valor efectivamente observado representará o erro do modelo.

Os valores apresentados como “Novos casos (previsão)” representam o número de casos previstos para os 3 dias seguintes, em referência à última data de reporte de dados.

Tempo de duplicação

O tempo de duplicação de novos casos é obtido através da taxa de crescimento exponencial (r) calculada no modelo linear logarítmico, segundo a fórmula:

\[ T_{d} = \frac{ln(2)}{ln(1 + r)} \] Quanto maior for o valor do tempo de duplicação, menor será a velocidade de progressão da transmissão.

\(R_{t}\)

O número reprodutivo no período temporal t (‘\(R_{t}\)’) estima o número médio de casos secundários infectados por um caso durante o seu período infeccioso, para o período de tempo t. Sendo assim, este número mede a dinâmica de transmissão de uma infecção num período temporal específico, podendo ser usado como um indicador “instantâneo” da transmissão (velocímetro).

Tal como um velocímetro, \(R_{t}\) permite indicar quão rápido decorre a transmissão (se \(R_{t}\) estiver acima de 1, a transmissão está a decorrer a um ritmo elevado e a epidemia está a alargar-se), bem como se esta se encontra em aceleração ou desaceleração, ao longo de um determinado período de tempo (ou seja, se \(R_{t}\) se está a afastar ou aproximar de 1, respectivamente).

O período temporal de cálculo utilizado abrange uma janela temporal de 7 dias. Exemplificando, o valor de \(R_{t}\) reportado em 17-03-2020 diz respeito ao período temporal de 7 dias que termina nesse dia (11 a 17 de Março). Este elemento deve ser acautelado na interpretação do valor de \(R_{t}\) como sendo reflexo de uma janela de transmissão que decorreu, para este cálculo concreto, nos últimos 7 dias.

Foi utilizado o método de cálculo de \(R_{t}\) de Cori A., et. al.. O cálculo deste número requer a definição de uma estimativa do intervalo de série (serial interval) - número de dias entre o início de sintomas de um caso e o início de sintomas de um caso secundário do primeiro - para a infecção em estudo. Para o efeito, foram utilizados os valores reportados por Abbott S., et. al. - média de 4,7 dias (Intervalo de Credibilidade 95% [CrI 95% CrI]: 3,7 - 6,0) e desvio padrão de 2,9 dias (CrI 95% : 1,9 - 4,9)).

Os cálculos foram efectuados com o software R, versão 3.6.1, e pacote EpiEstim versão 2.2-1.

Não foi considerado o efeito dos casos importados.

Não foi considerado, nesta fase de análise, o atraso de reporte dos novos casos.

Os dados do novos casos por dia foram calculados com base no boletim diário da Direcção-Geral da Saúde.

Autores da análise

André Peralta-Santos e Luís Alves de Sousa

Resposta SNS 24

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Atendidas (últimas 24h)

Não atendidas (últimas 24h)

Percent. não atendidas (últimas 24h)

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